"Delle fortificazioni" dove fu uno dei primi a rappresentare le piante delle piazzeforti con tracciato geometrico; sempre nel 1570 diede un sistema che può dirsi una combinazione del bastionato e di quello a tanaglie e fu imitato dalla scuola tedesca più di un secolo dopo.

Profilo di fortificazione disegnato dall'Alghisi

Per le mura rinascimentali di Lucca, partire dal 1491 si rendevano necessari altri ampliamenti della città ed ammodernamenti in ossequio alle nuove tecniche fortificatorie; Le prime notizie parlano di consulenze richieste a Matteo Civitali e Francesco di Giorgio Martini, ma non restano alcune testimonianze di effettivi progetti; Le costruzioni iniziarono nella prima metà del secolo successivo, con cortine fiancheggiate da grandi rondelle, secondo le teorie del fuoco di rovescio. Il progresso delle tecniche d'assedio rese presto obsoleti questi torrioni, e tra il 1544 e il 1575 l'Offizio di Fortificazioni del comune stipendiò gran parte del Gotha degli ingegneri militari dell'epoca. Il primo ingegnere militare di fama ad essere consultato fu Galeazzo Alghisi. Nel continente grande eco ebbe la costruzione della cittadella di Anversa ad opera di Francesco Paciotto e Galeazzo Alghisi che creò un nuovo modello di architettura militare.

Sulla piazza della Libertà di Macerata si trova la Torre Civica, iniziata da Matteo d’Ancona intorno al 1490 e terminata circa 150 anni dopo, su disegni di Galeazzo Alghisi da Carpi; è alta 64 metri